潮州民居均恪守对称的布局，它们都有明确的中轴线，以厅堂为中心组织空间，左右对称、主次分明，规模大时则纵向延伸或横向发展，规模更大时则多厅堂组合，或并列数条轴线，形成多院落组成的大型民居，因为带有祭祖、敬神的功能，因而厅堂的中心地位在空间组合中处无可替代的重要位置。为使空气流通，采用前低后高，巷里对直以兜风入室，此所谓之“露白”，加强了室内的穿堂风和足够的日照。 合院式民居的优点是有一个与外界隔离的内向院落小环境，它能满足家庭生活的安宁、、lun理等方面的需求，因而成为大部分地区共同的住宅形式，潮州民居的大部分类型为这种形式。
当时，各行各业人士都拿出自己的东西捐给祖庙，禅城当时手工出名的石湾瓦也被放在了祖庙的屋脊上。 上个世纪70年代初，灵应祠大堂后面庆真楼的砖木结构改成了混泥土结构。五行山墙山墙在潮汕地区也叫“厝角头”，是当地民居中比较讲究的部位。据当时参加了修缮工作的梁诗裕先生说，当时动用了100多人共花了一年多时间才完成修缮工作。 上个世纪70年代还没有设立禅城博物馆，祖庙旁边是关帝庙、妈祖庙等，后来才把它们拆了修建禅城博物馆，因此用博物馆的概念来评价祖庙是不准确的。1998年，庆真楼变成危房，加固后又重新使用。
所谓通透，是指建筑从整体上注意透风，既有利于建筑材料去潮防朽、延长寿命。更着眼于地处带地区的潮州长夏无冬的自然气候条件下，使居住活动舒适凉快。整套制作工艺完成后，仍然要使灰塑雕塑保持两天合适的湿度，以使得颜料被雕塑完全吸收。潮州民居注重整体环境设计达到室内降温效应，形成一个适宜人居的冬暖夏凉的建筑环境。为使空气流通，采用前低后高，巷里对直以兜风入室，此所谓之“露白”，加强了室内的穿堂风和足够的日照。在民居向大型化组合发展的情况下，横纵之间以火巷、屏风、槅扇等相隔，既通风、又防火、便交通、达到形式上的分隔。就是照壁、砌砖窗花、厅堂、门口采用的门罩、拦干门、闪门、博古等空间分隔构件，都以不同材料做成通雕，以利空气对流，达到分而不隔，更使石雕木雕等传统工艺有用武之地。木结构多采用彻上露明造，让所有之建筑构件通风透气，木材尽量外露以防白蚁、防腐朽，庭院内多为敞厅，门窗多朝天井，一般人的天井都设有花圃、水池、花木、莲缸、四季常青、静谧幽雅、更有利于调节室内温度。这些都淋漓尽致地体现了潮州民居的通透特点。
它建于明 正德十六年（1521年），是禅城目前保存完整早的砖雕装饰艺术之一。陈列馆内，有一幅目前国内仅存的黄飞鸿真人照片，很多游客到了这里必须要和大师的照片合影。祖庙大殿三门前两侧，端肃门上的砖雕“大红袍”（海瑞故事）、崇敬门上的“守房州”（牛皋故事）。这些砖雕的主要特色是：雕刻细腻，层次多，构图集中概括，主体感强，雕刻工艺娴熟，多用圆雕、透雕、浮雕、刀法刚劲利落极富于装饰性。细心的游人在观赏祖庙的砖雕时可以发现在砖与砖的接缝处并无丝毫的痕迹，其制作工艺令人惊叹。