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实验室平面布局是实验室设计的基础，只有按照功能分区和工作流程的需求做好相应的平面布局规划才能确保后续的水、电、风等设计，可谓牵一发而动全身。因此平面布局设计阶段应尽可能地详细考虑工作和发展的需求，合理配置空间，尽量优化整合。对于高1级别的生物安全实验室，由于其造价昂贵，不宜盲目攀比建设，避免造成浪费。除了布局的优化和仪器设备的摆放位置的设计外，还应充分考虑到人员流动与物品流动的方向是否符合工作要求。例如，为了避免实验人员频繁跑动，前处理室应该和仪器室在同一楼层;气瓶室应和气相色谱仪、气质联用仪等仪器在同一楼层;尽量让单层面积扩大化，以避免楼层过多，每一层都要设置洗涤室、样品室以充分利用空间;生物安全室应合理布局洁净区、半洁净区、污染区，以避免交叉污染。
实验室建设包括技术和设备的更新，研究人员增加和现有研究员的能力提高等。
实验室正在向模块化发展，实验室的工作台可设计成活动的，服务柱可随时调节和移动，并且能充分利用实验室的空间，设计可以移动的隔断墙，可进行灵活隔断，固定在墙体或地板上的对接站包括电路、水路、气路以及通信等输入口，具有快速连接和断开的特点，方便与实验台组合即插即用。如对于精密仪器室和无菌室、配电室、不间断电源室而言，其消防就不能采用自动喷淋装置，而应采用气体灭火装置，以避免自动喷淋装置损坏仪器设备或破坏洁净环境。
实验室深化设计：按平面布局图示意图进行设计，各功能区使用面积符合各验室的基本需求，分清洁区、半污染区和污染区，即办公区、普通实验区和净化实验区，还应当考虑工艺流程，功能布局力求科学合，通风空调系统布置要根据建筑功能、平面分布及甲方的使用要求，综合技术、经济、管理等因素；同时考虑有害气体性质等因素。(4)安全设施包括消防喷水灭火系统，惰性气体灭火系统，安全柜，紧急事故淋洗器、洗眼器等。