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PCR实验室建设：在改造工程中发现：通过新建或改造的方式实现核酸检测能力，存在以下问题：建设周期长；成本不可控；质量、标准不可控；建筑改造存在风险；人、物流易形成院内污染；存在空气交叉风险污染可能；验收可能存在困难；实验室长期使用率低，投资回报比低。 相比于传统核酸检测实验室，方舱核酸检测实验室有着以下优势：
环境安全性高：独立于现有建筑物外，按照核酸检测 P2+ 实验室标准设计、生产，具有独立生物安全密闭环境，实现人、气、物单向流，实验舱内配置独立洗消间，废弃物经由消杀后收集，对周边建筑与环境无影响。
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PCR实验室布局：不同功能的工作区应是分隔独立的，各工作区有明显的标志，不能直通，如果紧密连接，需安装物品传递窗。试剂准备区和样品制备区为扩增前区； 扩增区和扩增产物分析区为为扩增后区，即从：试剂准备区——样品制备区——PCR扩增室——产物分析室，不得逆向流动。实验室的气流也应从扩增前区流向扩增后区，不得逆向流动。各工作区的顶部应该安装紫外灯，紫外灯波长一般为254mm,配置要求为每20㎡一支40W的紫外灯。
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PCR实验室各区功能及主要设备：试剂准备区：主要进行试剂的制备，分装和主反应混合液的制备。试剂盒用于样品制作的材料应直接运送至该区域。
样品制备区：主要进行样品的保存，核酸提取，贮存及其加入至扩增反应管和测定DNA的合成。 本区主要设备有冰箱，生物安全柜，离心机，加样器，振荡器等。本区的压力梯度要求为：相对于邻近区域为正压，以避免从邻近区进入本区的气溶胶污染，压力一般设计为+10Pa。
扩增区：主要进行DNA扩增项目。已制备的DNA模板(来自样品制备区)的加入和主反应混合液(来自试剂准备区)制备成反应混合液等也可在本区内进行。本区主要设备有：冰箱，加样器，离心机，扩增仪等。本区的压力梯度要求为：相对于邻近区域为负压，以避免气溶从本区漏出，压力一般设计为-25Pa。
扩增产物分析区：主要进行扩增产物的测定。本区主要设备有加样器，、和水浴箱等。本区的压力梯度的要求为：相对于邻近区域为负压，以避免扩增产物从本区扩散至其它区域，压力一般设计为-25Pa。
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PCR实验室控制防止污染环境的方法：
一、根据标准设定区域空气压力。选择全送全排的空调机机组，设置有效的中央空调通风系统，根据不同工作区域对空气压力的要求(正压或负压环境)，严格保证规定的空气压力。
二、严格划分工作区域。实验区应科学划分，每一实验区应有明显的标志(例如醒目的标牌或不同的地面色调)，以防止机器设备、实验试剂在不同实验区产生混淆。
三、健全完善实验室服务设施。为保证实验的顺利进行，实验室设施应尽可能完善，并根据实验的具体内容配置不同的仪器设备，如净化台、离心机、加样器等。
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